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许多以前对癌细胞的基因分析都集中在它们的DNA上，也就是说，基因信息的基本版本。这些研究检查了基因，以确定它们是否含有肿瘤特异性突变。此外，基因是否特别活跃或不活跃取决于肿瘤。

现在，ETH的研究人员通过仔细研究转录细胞DNA的RNA分子，已经迈出了更进一步的一步。但是在这些分子被用作蛋白质生物合成的蓝图之前，他们经历了一系列的细胞转化过程：在一个称为剪接的过程中，专门的酶切断了整个RNA分子的部分，并将这些分子连接起来。两边的序列。RNA分子可以以多种不同的方式拼接，专家称之为选择性拼接。换句话说，作为基因的拷贝，RNA分子可以根据拼接过程提供各种蛋白质形式的蓝图。

通常会发生可选的拼接

在对肿瘤特异性选择性剪接的分析中，rtsch和他的同事们研究了前所未有的基因癌症数据，并检查了8700名癌症患者的RNA序列，他们在许多癌症患者中发现了数万种以前没有描述过的选择性剪接变体。

研究人员还可以证明，在大多数癌症类型的检测中，癌症组织的选择性剪接比健康组织更频繁，尤其是在肺腺癌中，选择性剪接比健康样本中更频繁30%。

由于这项研究，研究人员对哪些分子因素导致癌症细胞高选择性剪接率有了新的见解。一些鼓励选择性剪接的突变已经被知道了，但现在研究小组能够识别其他四个基因。

免疫治疗的新对接点

癌症导致细胞分子和功能的改变。RTSCH团队的博士后研究员Andre E Kahles说，你可以说癌细胞的齿轮里有很多沙子。RTSCH团队是这项研究的两位主要作者之一。在分子水平上，变化不仅以个体DNA突变的形式发生，我们已经知道这一点。N在很长一段时间内，也以不同类型的RNA剪接形式存在，因为我们可以在综合分析中显示它们。

研究人员说，并非所有新发现的RNA分子的变化都必然导致癌细胞的功能变化。然而，分子差异可以为新的治疗方法提供依据，例如，具有典型癌细胞剪接模式的细胞可以通过免疫疗法进行治疗。

在靶向肿瘤免疫治疗中，人体自身的免疫系统被训练成识别典型的分子癌症标记物，这些标记物可以攻击和杀死癌组织。健康的人体组织是独立的。

目前，只有少数癌症患者可以用这种方法治疗，因为只有大约30%的病例有适合免疫治疗的特定肿瘤标记物。新发现的选择性剪接变体导致蛋白质变化，可作为肿瘤特异性标记物：高达75%的病例发现有这些新的标记物可用于治疗肿瘤。开发特定的药物。

大数据集的深入分析

简单地获取有关可变剪接频率的信息本身是非常有价值的。特别是，科学家认为许多剪接肿瘤特别容易受到其他类型的免疫治疗，即非靶向免疫治疗的影响。他们希望探索这个假设，作为ETH领域个性化健康和相关技术的一部分。（phrt）研究计划。

对于本文所描述的研究，研究人员分析了数百TB的原始数据。为了分析如此巨大的数据量，我们需要大量的计算机时间和快速存储系统。Ethertsch教授说，如果没有超级计算机，这项研究将不可能实现。他和他的同事们抵达苏黎世联邦理工学院2号。几年前，他们在纽约的斯隆凯特林癌症纪念中心开始了他们的研究。一到瑞士，他们就与ETH的IT服务部门合作，建立了莱昂哈德医学计算机系统，使他们能够安全地处理巨大的基因组和其他医学数据。